在分子和固体的势能面上定位过渡态来预测反应路径。
特性&功能
TRANSITION STATE LOCATOR使MAPS用户能够在分子和固体的势能面上找到过渡态。支持线性和二次同步渡越(LST/QST)与微动弹性带(NEB),并且可以在MAPS中使用多个量子引擎。
概述
TRANSITION STATE LOCATOR是一个独立的程序,它使用ABINIT、NWChem和MNDO来计算能量和力。MAPS中提供了图形用户界面来设置计算。过渡态可以用三种不同的方法定位。线性同步渡越法(LST)通过在连接反应物和产物的最短线上找到能量最高的点,来找到过渡态的估计值。
二次同步渡越法(QST)通过沿着与前一条垂直的直线找到最小值来进一步细化估计。然后可以在连接反应物,过渡态估计值和产物的路径上寻找一个鞍点。
微动弹性带法(NEB)可同时优化反应物和产物之间整个连接构型的结构。
结果是反应物和产物之间的能量路径最小,结构的能量最高,为过渡态提供了猜测。为了预测反应途径和研究化学反应的能量学和动力学,需要知道过渡态。
钌基均相催化剂催化甲醇还原反应。在TRANSITION STATE LOCATOR中使用NWChem和NEB对过渡态进行局部化。
参考文献
[1] T. A. Halgren, W. N. Lipscomb, 1977. Chem. Phys. Lett. 49 pp. 225-232.
[2] H. Jónsson, G. Mills, K. W. Jacobsen, 1988. Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations Ed. B. J. Berne, G. Ciccotti, D. F. Coker (World Scientific).