MAPS平台的建模工具提供了建立任何类型材料模型的图形界面，包括催化剂、(纳米)复合材料、高分子系统、交联体系、胶束、药物、合金、半导体、界面、双层结构；微孔结构、晶体结构、无定形材料和其它原子和介观模型。功能包括3D分子绘图、从数据库导入结构、轻松操作分子结构和高质量透视图打印或输出到PPT、以及创建动画视频。

· 分子绘图

构建复杂的分子模型，可实现添加、替换原子或分子集团(片段)，任意改变键长和键角。还提供高级功能，如自动结构优化或键粘结功能。​​

· 晶体建模

构建任意空间群结构的晶体结构和化合物，可调节晶格常数或所需要的任意周期性结构的原子位置。

· 界面建模

构建界面模型，通过合并两个独立的周期性系统（块体或表面），例如构建异质结。​​​

· 表面最低能量态搜索

构建一个分子在表面上最低能量时的模型。在材料表面上方指定的点转动分子，计算每个转动下体系的能量。对每个表面上各点对应的最低能量进行保存，用于更进一步的模拟和分析。

· 高分子建模

通过内置的单体数据库(含有常用单体或用户自定义单体)，将任意单体单元组合创建成高分子链。可以根据所需要的高分子等规度构建随机或嵌段共聚物。

· 介观尺度建模

通过特定的结构如颗粒、薄片或膜，构建复杂介观尺度系统。

· 碳纳米管建模

根据指定的尺寸和手性构建碳纳米管。

· 在线晶体数据库

通过访问在线晶体结构数据库，检索晶体结构和已发表的文献。